El armamento es manejado por el sistema ACS ( Sistema de Control de Armamento) que monitorea, selecciona y arma la carga belica. El ACS basicamente esta constituido por dos sistemas el sistema de soportes de armas y un conjunto de computadores de a bordo. El ACS recibe informacion desde el AIS (sistema de informacion del blanco y lanzamiento) seleccionando automaticamente el arma apropiada para el blanco elegido. Cualquier dato critico desde el ACS puede ser monitoreado todo el tiempo en el presentador HUD.

Carga Belica

El Eurofighter cuenta con un 13 extaciones externas para armamento y combustible auxiliar, 4 en cada ala y 5 en el fuselaje, puede aproximadamente 7500 kg de carga belica. En consideracion a reducir su Seccion de Cruce de Radar, condicion que al ser mejor le permite una menor imagen en la pantalla de radar, se ha hecho una considercion especial en su construccion. El sistema de misiles es lanzado por un equipo desarrollado por GEC denominado WPSU (Unidades de Estacion en las Alas). Los msiles en el borde del ala del tipo SRAAM estan debajo de ala dentro de un borde curvo construido para minimizar al maximo su imagende radar. Se espera que los dos soportes interiores puedan transportar una carga de 1500kg sienpo capaz de portar los misiles Storm Shadow y Taurus. Los soportes exteriores podran cargar el sistema MRAAM de ataque a tierra. Ademas podran cargar en el fuselaje semicarenados misiles y sistema de bombas. 

Cañon interno

Durante la Guerra de Vietnam se vio la necesidad de dotar a los aviones occidentales de un sistema de cañon, ya que confiar la defensa contra otros aviones solamente a los misiles ponia en inferioridad a estos aparatos con los cazas sovieticos. El Eurofighter esta equipado con el cañon BK-27 MauserWerke Gmbh instalado internamente; este se convirtio en el arma standard de los aviones europeos de la epoca como el Panavia Tornado y el SAAB/BAE Gripen. Esta arma utiliza un proyectil de 27mm altamene explosivo con una cadencia maxima de 1700 rondas/minuto, cada avion cuenta con 150 ronda. Se dispone de diferentes clases de municion desde la altamente explosiva hasta la antitanque. El cañon pesa 100 kg y combina una alta velocidad de disparo con una gran capacidad de municion. El cañon es manejado desde el HUD, cuenta con un sistema automatico  de disparo. 

El Eurofighter cuenta con una adecuada carga de combustible para desempeñar su tarea de patrulla CAP. Existen varias formas de tanques elegibles, dependiendo del perfil de la msion a realizar. Existen tres puntos capaces de cargar combustible, llamados puntos mojados y estan conectados al sistema interior de suministro. EStas posiciones son la central en cada la y la central en el fuselaje. Una de las versiones es la Tornado Hindenburg diseñada para vuelo subsonico y de bajo G, carga aproximadamente 1500 litros y puede ser usado en los puntos de cada ala. El otro tipo esta diseñado para vuelo supersonico y de alto G, este sera usado por el Typhoon y podra cargar 1000 litros. Con los tres tanques acopplados el Eurofighter doblara efectivamente su capacidad de combustible. Ademas esta en desarrollo un sistema denominado de Tanques Conformados de Combustible CFT;  estan diseñados para seguir el perfil del fuselaje del avion. Ello permite que puedan portar mayor cantidad de combustible, sin alterara de manera significativa el arrastre al viento y la imagen de radar. 

Sistema de Armas Aire-Superficie

A pesar de que el Eurofighter ha sido diseñao como un avion de superioridad aerea, el cuenta con capacidad multiproposito. Por ello se lo ha dotado de la capacidad de portar un gran numero de armas como LGB, ALARM y bombas de cida libre. Los nuevos sistemas de armas relacionados con las del tipo JDAM requieren modificaciones en sus sitemas o equipo adicional para optimizar su uso.