Este entrenador utilizado por la mayoria de las fuerzas del Pacto de Varsovia, fue diseñado antes de la intervencion sovietica en Checoeslovaquia en 1968, destinado a reemplazar al L-29 Delfin. La Aero construyo tres prototipos, el segundo de los cuales volo por primera vez en Noviemnre de 1968, pilotado por Rudolf Duchon tambien piloto del prueba en el L-29.

La clave de la mejora en las prestaciones del L-39 sobre su antecesor esta en la adopcion del motor Ivchenko AI-25 cuya potencia es el doble del turborreactor Motorlet que impulsaba el L-29. Sin embargo solo se autorizo iniciar su produccion en 1972, pues el programa se reetraso al querer utilizar una celular igual a la del L-29. Las evaluaciones operativas se hicieron en 1973 y el aparato empezo a entrara en servicio a principios de 1974. Para 1979 se habian construido un total de 1000 unidades, de los cuales aproximadamente la mitad estaban ya terminados. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Su construccion es modular, con una estructura dividida en tres subconjuntos principales (alas, fuselaje y fuselaje posterior/unidad de cola) esto facilita el mantenimineto y revision. Toda el ala, a excepcion de sus partes moviles forma una sola pieza, incluidos los depositos de la punta del  ala y el plano de deriva en flecha esta integrado en el fuselaje de la cola. Desde ambas cabinas que son presurizadas se dispone de una magnifica visibilidad en todos los sentidos. 
Existen tres variantes principales del L-39C basico, para entrenamineto elemental y avanzado en reactores, se entregaron gran numero de uniades a las Fuerzas Aereas Checas, sovieticas y otras naciones del Pacto de Varsovia en 1974. 

En su version de entrenamiento para armamento se lo conoce como L-39Z y el L-39Z0 armada y monoplaza para uso en misiones de ataque al suelo y apoyo cercano, en esta version se elimino el asiento posterior a fin de habilitar un espacio en caso de necesidad, para la avionica o un deposito adicional de combustible. El avion cuenta con una pequeña unidad auxiliar de potencia, locual le permite precindir de una toma electrica en tierra para el arranque de los motores, circulacion de combustible y otros. Finalmente se produjeron 1500 aviones, de los modelos L-39 de entrenamiento basico y avanzado; L-39V de remolque de balncos; L-39ZO de entrenamiento armado y L-39Z de atque al suelo y reconocimiento.